CAS9質粒系列
CRISPR/Cas基因組編輯工具系統涉及到sgRNA和Cas9兩種成分。在細胞內,Cas9蛋白在單一的向導RNA(sgRNA)引導下識別并切割基因組上的目標靶位點,從而在基因組上人為定向制造出雙鏈斷裂(DSB)。DSB一旦形成,會激發細胞內源性的DNA損傷修復機制以修復DSB。細胞內的DNA修復包括非同源末端連接修復(NHEJ)、微同源介導的末端連接修復(MMEJ)和同源重組修復(HR)等三種主要形式。前兩種修復均為易錯修復,修復的結果是在DSB附近形成插入/缺失突變。如果插入/缺失突變是個移碼突變且發生在關鍵功能結構域對應的外顯子上,則可能使目標基因因移碼而不能編碼出有活性的蛋白,從而成為一種無效等位基因,結果導致基因敲除;如果同時向細胞內提供同源供體,則這些供體會有機會被當作用于DSB修復的同源供體,結果細胞通過HR修復,成功實現在指定位置的基因敲入。
dCas9-Eve真核表達質粒,CMV/dCas9-Eve;人密碼子偏好性優化的dCas9-Eve
dCas9-Eve原核表達質粒,T7/dCas9-Eve;人密碼子偏好性優化的dCas9-Eve
dCas9真核表達質粒pYSY-CMV-dCas9,CMV/dCas9;人密碼子偏好性優化的dCas9
dCas9原核表達質粒pYSY-CMV-dCas9,T7/dCas9;人密碼子偏好性優化的dCas9
Cpf1原核表達質粒,人密碼子偏好性優化的Cpf1
SaCas9(小Cas9)真核表達質粒pYSY-CMV-SaCas9,人密碼子偏好性優化的SaCas9(3.16kbp,比SpCas9小1kb)
SaCas9(小Cas9)原核表達質粒pYSY-T7-SaCas9,人密碼子偏好性優化的SaCas9(3.16kbp,比SpCas9小1kb)
eSpCas9(高保真Cas9)真核表達質粒,CMV/eSpCas9;人密碼子偏好性優化的eSpCas9
eSpCas9(高保真Cas9)原核表達質粒;T7/eSpCas9;人密碼子偏好性優化的spCas9
SpCas9植物細胞表達質粒,2×35S啟動子/Cas9,水稻密碼子偏好性優化的Cas9